波萃取設備的萃取機理可從兩方面進行理解，一方面微波輻射過程是高頻電磁波穿透萃取介質，到達物料的內部纖維管束和腺胞系統。吸收微波后細胞內部溫度迅速上升，使其細胞內部壓力超過細胞壁膨脹承受能力，細胞破裂。細胞內有效成分自由流出，被萃取介質捕獲并溶解。通過進一步過濾和分離，便獲得萃取物料。另一方面，微波所產生的電磁場加速被萃取部分成分向萃取溶劑界面擴散速率，用水作溶劑時，在微波場下，水分子高速轉動成為激發態，這是一種高能量不穩定狀態，或者水分子汽化，加強萃取組分的驅動力；或者水分子本身釋放能量回到基態，所釋放的能量傳遞給其他物質分子，加速其熱運動，縮短萃取組分的分子由物料內部擴散到萃取溶劑界面的時間，從而使萃取速率提高數倍，同時還降低了萃取溫度，***限度***萃取的質量。
　　2微波萃取優點。傳統熱萃取是以熱傳導、熱輻射等方式由外向里進行，而微波萃取是通過偶極子旋轉和離子傳導兩種方式里外同時加熱。這就是微波加熱萃取效率較高的原因。傳統熱萃取和傳統熱萃取相比，微波萃取具有以下特點：ａ、質量高，可有效地保護食品、藥品以及其他化工物料中的功能成分；ｂ、產量大；ｃ、對萃取物具有高選擇性；ｄ、省時，可節省 50 ％～90％ 的時間；ｅ、溶劑用量少（可較常規方法少50％～90％）；ｆ、低耗能 。
　　微波輻射技術在食品萃取工業和化學工業上的應用研究雖然起步只有短短幾年的時間，但已有的研究成果和應用成果已足以顯示其以下優越性 ： ａ、反應或萃取快；ｂ、產率高，產品質量好；ｃ、后處理方便；ｄ、安全； ｅ、無污染，屬于綠色工程；f 、生產線組成簡單，節省投資；
　　3微波萃取的應用。微波萃取技術是食品和中藥有效成分提取的一項新技術。現已廣泛應用到香料、調味品、天然色素、中草藥、化妝品和土壤分析等領域。微波萃取效率高、純度高、能耗小、產生廢物少、操作費用少、符合環境保護要求。可廣泛用于中草藥、香料、保健食品、化妝食品、化妝品、茶飲料、調味料、果膠、高粘度殼聚糖等行業，目前在我國微波萃取已經用于多項中草藥的侵取生產線之中，如葛根、茶葉、銀杏等。微波萃取已列為我國二十一世紀食品加工和中藥制藥現代化推廣技術之一。某中藥研究機構的科研工作者，已經用微波萃取方法處理上百種中藥。無論是萃取速度、萃取效率還是萃取質量均取比常規工藝***得多的結果。
　　4微波萃取與其它萃取方法的區別。微波加熱萃取技術與現有其他的萃取技術相比有明顯的優勢。化學溶劑萃取法耗能大、耗材多，耗時長，提取效率低，工業污染量大。超臨界流體提取在提取效率上得到***提高，但其方法要求的裝備復雜，溶劑選擇范圍窄，需高壓力容器和高壓泵，故投資成本較高，建立大規模提取生產線有工程難度。 微波萃取與傳統的超臨界萃取 (SFE) 殺蟲劑的回收率無多大差別，但明顯節省溶劑和時間，且可同時處理多個樣品。同時研究表明，微波提取的***回收率與提取溫度，植物樣品的基體及殺蟲劑類型密切相關，針對不同的樣品，不同的殺蟲劑，采用相應的提取溫度及時間，獲得比超臨界萃取高的回收率是完全可行的。
　　5微波萃取工藝流程。 選料——清洗——粉碎——微波萃取——分離——濃縮——干燥——粉化——產品